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生物信息學專業(yè)MySQL數(shù)據(jù)庫課程教學方法探討論文
摘要：該文根據(jù)MySQL數(shù)據(jù)庫特點，結合生物信息學專業(yè)特色，提出了理論與實踐結合、項目與任務結合、考核與教學反思結合的教學方法，調動學生的學習主動性，使學生充分認識到MySQL數(shù)據(jù)庫課程在生物信息學數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)處理等方面的重要作用，督促學生全面掌握數(shù)據(jù)庫相關知識，通過項目與任務結合培養(yǎng)了學生的實踐能力，很好地完成了教學任務，達到了預期效果。
關鍵詞：MySQL數(shù)據(jù)庫生物信息學
中圖分類號：G64文獻標識碼：A文章編號：1674-098X（2016）02（b）-0141-02
隨著計算機技術和生物技術的快速發(fā)展，MySQL數(shù)據(jù)庫課程不僅是計算機類專業(yè)、信息管理專業(yè)的重要專業(yè)課程，也是生物信息學專業(yè)的必修課程。MySQL數(shù)據(jù)庫作為應用型課程，其課程體系注重培養(yǎng)學生利用數(shù)據(jù)庫技術解決實際問題的能力，然而由于專業(yè)方向、教學手段、考核方式等方面的限制，容易使學生學習目標不明確、缺乏學習興趣，導致學習效果較差。如何改變生物信息學專業(yè)的MySQL數(shù)據(jù)庫教學現(xiàn)狀，是值得深入思考的問題，該文從教學實踐出發(fā)，探討MySQL數(shù)據(jù)庫課程在生物信息學專業(yè)中的重要性和教學方法。
1MySQL數(shù)據(jù)庫特點
MySQL由瑞典MySQLAB公司開發(fā)的一款開放源碼的中小型關系數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)，是當前網(wǎng)站開發(fā)中尤其是PHP開發(fā)中使用最為廣泛的數(shù)據(jù)庫。MySQL支持多線程充分利用CPU資源，提供TCP/IP、ODBC和JDBC等多種數(shù)據(jù)庫連接途徑，支持Linux、Solaris和Windows等多種操作系統(tǒng)，使用系統(tǒng)核心提供的多線程機制提供完全的多線程運行模式，提供了面向C、C++、Java、Perl、PHP和Python等編程語言接口，優(yōu)化SQL查詢算法，可有效地提高查詢速度。它具有操作簡單、體積小、速度快等優(yōu)點，語法簡單，容易被學生理解和接受，在編寫網(wǎng)站應用程序時，幾乎離不開數(shù)據(jù)庫，所以，在教學中選取MySQL作為教學用數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)。
2MySQL數(shù)據(jù)庫課程教學方法研究
MySQL數(shù)據(jù)庫具有很多特點，是網(wǎng)站應用程序不可缺少的重要部分。對于生物信息學專業(yè)的學生而言，使用很多數(shù)據(jù)庫，如，NCBI、UCSC等進行生物數(shù)據(jù)檢索，而獲得數(shù)據(jù)后，如何進行數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)處理和分析成為一個重點難點問題。學習MySQL數(shù)據(jù)庫課程，能使學生快速地掌握使用方法，提高處理數(shù)據(jù)效率。為保證良好的MySQL數(shù)據(jù)庫教學效果，從以下幾方面開展教學方法研究和實踐。
2.1理論與實踐緊密結合，調動學生學習興趣
根據(jù)MySQL數(shù)據(jù)庫理論性和應用性強的特點，為使學生全面掌握數(shù)據(jù)庫基本知識和技能，提出理論與實踐緊密結合的教學方法，重視課堂理論知識的傳授，緊密結合實踐訓練。例如：理論學習關系數(shù)據(jù)庫模型時，引入實例，指導學生從GenBank數(shù)據(jù)庫獲取核酸和蛋白質序列，調動學生主動思考，如何存儲為關系模型數(shù)據(jù)，加深學生對關系模型的理解和應用，并為同學分配任務，進行核酸和蛋白質序列的查詢、修改關系操作，通過這種具有專業(yè)特色的理論學習與實踐訓練相結合的教學方法，使學生掌握了MySQL數(shù)據(jù)庫理論知識的同時，也激勵同學主動開展實踐訓練，能夠使枯燥的理論知識變得生動有趣，使學生認識到MySQL數(shù)據(jù)庫課程的重要性，進一步促進生物信息學專業(yè)課程的學習。
2.2項目與任務驅動結合，培養(yǎng)學生動手能力
針對MySQL數(shù)據(jù)庫課程的特點，開展項目與任務緊密結合的教學方法。總體上將課程劃分為若干階段的教學過程，并將教學過程分解在一個項目案例MySQL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中。例如：構建人類疾病相關基因數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，將該項目劃分按照數(shù)據(jù)庫設計周期劃分為以下6個階段：需求分析階段、概念結構設計階段、邏輯結構高設計階段、物理結構設計階段，數(shù)據(jù)庫實施階段和數(shù)據(jù)庫運行與維護階段，分配子項目和子任務，包括人類疾病相關基因數(shù)據(jù)的獲得與處理、轉化為關系模型結構數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)模式分解、MySQL數(shù)據(jù)庫構建、關系表構建、數(shù)據(jù)類型設置、數(shù)據(jù)導入、創(chuàng)建索引、視圖、觸發(fā)器以及存儲過程等，充分調動學生學習的主動性，發(fā)揮主觀能動性，用項目和任務引導學生學習知識點，即把知識點的講授貫穿在實際應用項目的開發(fā)過程之中，指導學生掌握實際的MySQL數(shù)據(jù)庫的分析、設計與開發(fā)過程，培養(yǎng)學生動手研發(fā)能力。
2.3考核與教學反思結合，優(yōu)化教學內容
目前，MySQL的數(shù)據(jù)庫課程理論與實踐考核存在考核過程效率低、考核內容覆蓋面小、考核方法少等問題使教師難以全面掌握學生的學習效果，所以，在考核過程中督促學生全面掌握數(shù)據(jù)庫相關知識，提出了可靠的理論與實踐考核方法，即制訂合理的考核內容計劃，構建全面的數(shù)據(jù)庫、試題庫、理論試題庫和實踐試題庫，全面覆蓋表與數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)建、表結構的修改及索引的創(chuàng)建、數(shù)據(jù)操作、查詢及視圖、觸發(fā)器與存儲過程的創(chuàng)建、用戶與權限管理等，結合生物信息學專業(yè)知識進行理論和實踐考試，保證理論考試和實踐考試能夠全面真實地反映學生的掌握水平。同時，進行教學反思，即時糾正教學過程中還存在的問題，對于課堂上學生提出的一些獨特見解給予充分肯定，推廣的好方法、好思路、好見解，完善教學過程，拓寬教師的教學思路，提高教學水平。
3結語
MySQL數(shù)據(jù)庫課程是生物信息學專業(yè)的重要專業(yè)基礎課，具有較強的應用性。該文根據(jù)MySQL數(shù)據(jù)庫特點，結合生物信息學專業(yè)特色，提出了理論與實踐結合、項目與任務結合、考核與教學反思結合的教學方法，不僅調動學生的學習主動性，而且在實踐過程中使學生充分認識到MySQL數(shù)據(jù)庫課程在生物信息學數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)處理等方面的重要作用，通過數(shù)據(jù)庫試題庫進行理論與實踐考核，督促學生全面掌握數(shù)據(jù)庫相關知識，通過項目與任務結合培養(yǎng)了學生的實踐能力，很好地完成了教學任務，但具體教學過程中可能還會存在一些問題，這需要教師根據(jù)課程環(huán)境進行即時調整不斷地完善，使MySQL數(shù)據(jù)庫課程在生物信息學專業(yè)中發(fā)揮更重要的作用。
參考文獻
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